輸卵管發育不良或畸形，會使輸卵管輸送孕卵的功能減退，不易使受精卵順利到達宮腔。常見的有：輸卵管彎曲、螺旋狀、雙輸卵管口等。

精子、卵子在一側輸卵管受精后，由于某種因素的影響，受精卵沒有向宮腔方向移動，它從受精側的輸卵管外游，通過腹腔進入到對側的輸卵管內，由于長途運行，當它還沒到達宮腔之前，受精卵已發育到該植入的階段，于是就在對側的輸卵管內生長。

盆腔炎或者盆腔有腫物的女性，因為腫物的擠壓和牽引，使子宮或輸卵管位置移動，形態變化，甚至導致結構異常，這些變化有時就影響孕卵正常到達宮腔。

做過輸卵管結扎手術的女性，后面再通或瘺管，就容易發生輸卵管妊娠。這是因為再通的輸卵管不像以前那樣暢通，再通處比較狹窄，孕卵容易被阻留在輸卵管狹窄處。

女性多次做人工流產，會導致子宮內膜創傷，胚胎不易在子宮腔內著床，就會轉移到別的地方著床，發生異位妊娠。

避孕藥會影響女性血漿中的雌、孕激素水平，繼而影響輸卵管壁的蠕動、纖毛活動以及上皮細胞的分泌。如果激素失調，將會影響受精卵的運送而發生輸卵管妊娠。有些女性缺乏自我保護意識，且沒有長效避孕措施，濫用避孕藥，就會增加宮外孕的危險。

之前有過宮外孕史的女性再患上宮外孕的可能性很大，因為本身可能宮外孕的病因沒有康復，再加上手術后的一些炎癥或者粘連，都會增加宮外孕的幾率。